计算准确的能垒

https://www.orcasoftware.de/tutorials_orca/react/actibar.html 除了研究化学反应的机理细节外,ORCA 还可用于计算准确的能垒,从而以一定的精度预测反应速率。 这里必须清楚,将实验能垒的绝对值与计算的能垒的绝对值进行比较是相当困难的。首先,因为这些“实验”值从来都不是直接测量的,而是经过一系列假设后

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Introduction to Molecular Modelling: Part 4 (Transition States)

This is part of the ongoing series of blogs where I write about the how-to of the molecular modelling. This is mainly focused on the software side of it (GAMESS). Modelling transit

化学

在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题

0 前言 IRC是量子化学研究化学反应的重要概念,它是质权坐标下连接势能面相邻两个极小点的能量最低路径,描述了化学过程在不考虑热运动因素下最理想的结构变化轨迹,对于讨论微观化学过程至关重要,而且也是验证过渡态找没找对的最决定性的方法。《过渡态、反应路径的计算方法及相关问题》中有很多介绍和讨论,建议看看。 在Gaussian中计算IRC的问题是笔者在网上被问及

化学

将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析

0 前言 在《盘点Grimme迄今对理论化学的贡献》(http://sobereva.com/388)一文中笔者曾简单提到GFN-xTB方法,说白了就是类似于DFTB那种半经验意味的DFT,精度不错普适性也好,对与之耗时相仿佛的半经验方法和DFTB带来了极大的冲击。Grimme开发了名为xtb的专门做GFN-xTB计算的程序。xtb程序用过的人都说好,速度很

化学

Gaussian教程 | 搜索过渡态

摘要:本文以1,3-丁二烯的顺反构象异构体转化为例详解了:(1)如何用量化计算软件高斯(Gaussian)的TS、QST2、QST3三种方法来搜索过渡态(Transition state)结构;(2)如何确认过渡态结构;(3)如何构建反应路径以及计算反应能垒等。 一.搜索过渡态的基本原理 1.基本概念 过渡态(transition state):过渡态理论认

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